综合业务处：负责机关日常运转,承担机关文电、会务、信息、督查、机要、保密、档案、政务公开、后勤服务、宣传发布等日常工作；承担局机关财务、资产管理、内部审计等工作；负责机关和直属单位的组织人事、机构编制、干部教育培训、人才队伍建设、组织协调退役军人事务政策理论研究工作；组织办理人大建议和政协提案的答复；组织起草地方性相关法规草案和规章；承担行政审批制度改革和规范性文件的合法性审核工作；承担自治州退役军人事务机构的规范性文件的起草、审查行政复议和行政应诉等工作；承担退役军人思想政治、舆论宣传、舆情管控、情报分析和事迹材料的编写整理；拟定自治州退役军人事业发展规划和退役军人管理保障基础设施建设标准；协调军供保障机构的规划政策并指导军用饮食供应站组织实施；负责协调落实退役军人和无军籍退休退职职工及其他优抚对象的住房建设与保障，指导和监督退役军人事业资金管理；负责全州退役军人诉求征询、信息联络和自治州退役军人事务局的信访调解和档案登记及协调化解和应急处置工作；承担落实自治州退役军人领导小组办公室日常交办的业务工作。

移交安置和就业创业处：拟订落实军队转业干部及自主择业、复员干部和退役士兵年度安置计划和就业创业计划；执行退役军人留疆优惠优待政策；承担计划分配的军队转业干部、符合条件的退役士兵年度安置计划的组织实施；承担州本级和中央驻疆单位、国有大中型企业计划安置和计划外选调工作；组织实施军队转业干部、退役军人教育培训工作。负责移交地方的军队离休退休干部、无军籍退休退职职工的移交安置和服务管理；组织退役军人就业创业促进和教育培训工作；负责全州退役军人信息采集、统计、大数据平台建设使用和管理工作；协调指导州自主择业军队转业干部管理服务中心、州军队离退休干部管理服务站的业务工作；协调指导随军随调家属就业创业，落实服务管理和待遇保障政策；协调指导做好企业军转干部解困稳定工作；协调指导自治州退役军人事务系统服务中心、服务站的业务工作。

拥军优抚和权益维护处：负责落实执行自治州拥军优属工作；负责指导自治州支持部队承担相关业务工作；指导退役军人权益维护和有关人员的帮扶援助工作；协调指导自治州光荣院、自治州伤残军人康复中心等的业务工作；组织实施拥军优抚相关政策法规，承担现役军人、退役军人、军队文职人员和军属优待、抚恤等工作；组织落实退役军人医疗保障工作；负责优抚对象和生活困难的部分退役军人生活、医疗等救济工作；落实参加抗战、解放战争，对印、对越和维稳处突作战的退役军人等有关人员优待政策；负责申报因公伤残人民警察和公务员评残工作，负责符合条件退役军人纳入优抚对象保障范围；承担自治州烈士评定的审核和备案申报；承担不适宜继续服役的伤病残军人相关工作；落实有关退役军人医疗、疗养、养老等优抚保障机构的规划政策并指导实施；承担对在社会各界作出杰出贡献的烈士褒扬、退役军人表彰、荣誉奖励等工作；承担纪念设施管理保护工作；承担英雄烈士保护相关工作；制定纪念馆、纪念碑和军人公墓建设规划及组织实施管理维护等政策并指导实施；组织指导实施烈士事迹编纂宣传和英雄烈士纪念活动；承担自治州双拥工作领导小组办公室的日常业务工作。

机关党委：机关党委职责同